A GM Algodoeira é responsável por beneficiar todo algodão após a colheita. Separando a fibra das sementes, onde são removidas as impurezas como poeira e folhas. Em seguida a fibra é classificada e compactada em fardos para ser comercializada. O caroço, tambem é comercializado para a produção de ração e oléo. A usina desempenha um papel fundamental na agregação de valor ao algodão e na geração de subprodutos.